Тысячи живописных озер придают неповторимый колорит горному пейзажу. Они многолики по происхождению заполняемых ванн, но питанию и режиму, по водному царству растительного и животного мира. Поистине «священным Байкалом» Алтайских гор является Телецкое озеро. Ю. К. Ефремов по праву назвал Телецкое озеро перлом природы не только Алтайского заповедника, и всего Алтая.
Леса Горного Алтая богаты и разнообразны. Здешнюю тайгу образуют сибирский кедр, лиственница, ель, немало пихты, березы и осины. В северных предгорьях обычны сосновые массивы. В лесах водятся многие промысловые звери. В среднегорье работает природно-климатический курорт Чемал, а на севере предгорий —- Российская здравница Белокуриха, Но едва не главное богатство Горного Алтая естественные луга — замечательные пастбища. Они занимают почти пятую часть территории гор. Пышную и красочную оранжерею алтайских лугов нередко сравнивают с Большим Кавказом, а необычный гигантизм трав субальпики спорит с высокорослыми «травянистыми лесами» Дальнего Востока.
Алтай — мир многоэтажного горного ландшафта. Здесь радужно выделяются разнотравно-злаковые степи, вклинившиеся от соседних обширных равнин, черневая тайга, парковые лиственичные леса и кедровники, покрывающие каменистую зыбь гор, степи и полупустыни глубоких котловин, холодные тундры и заледенелые шатры альпийских пиков. В состав территории, которую по исторически сложившейся традиции называют Горным Алтаем, входят Республика Алтай, Алтайский, Солонешенский, Чарышский, а также часть Змеиногорского, Курьинского, Краснощековского, Усть-Калманского, Петропавловского, Смоленского, Советского и Красногорского районов Алтайского края.